DokuWiki verfügt über eine Plugin-Schnittstelle zur Erweiterungen bzw. Anpassung der Standard-Funktionalität. Wie die Anwendung selbst, sind auch die Erweiterungen quelloffen und können aus einem Online-Verzeichnis geladen werden.
Falls man in der großen Auswahl existierender Erweiterungen nicht fündig wird, besteht die Möglichkeit ein eigenes Plugin zu schreiben.